Při laboratorním vyšetření krve se u pacientů s onemocněním Morbus Crohn objevuje anémie (chudokrevnost), snížení hladiny železa v séru, zrychlená sedimentace červených krvinek, zvýšení hladiny bílých krvinek a krevních destiček, což jsou faktory pro aktivní zánět. Při rozsáhlém postižení střeva dochází k malabsorbčnímu syndromu na podkladě poruchy vstřebávání živin potřebných pro organismus pacienta a k následné podvýživě s nízkou hladinou krevní bílkoviny.
U pacientů s ulcerózní kolitidou se nachází v laboratorním obraze anémie, zvýšená hodnota bílých krvinek, v případě těžkých průjmů porucha vodního a minerálního hospodářství.